3月8日，他将想法告诉陈布雷，通过陈布雷向蒋介石提出了就任校长的三个条件：一，校长有用人全权，不受政党干涉；二，财政须源源接济；三，时间以半年为限。
3月16日，他以为蒋介石不会答应自己的条件，仍然和同事放飞了一枚探空氢气球，升空高达17714米，获得了弥足珍贵的气象资料，这在东亚各国属首例。
4月7日，蒋介石答应了他的条件，并根据国民政府行政院政治会议，正式通过竺可桢担任浙大校长的决定。
此后的13年间，竺可桢最主要的工作，从科学家转为了教育家。
4月25日，身材瘦削，举止优雅，戴一副圆圆的眼镜，看上去有点像苦行僧的竺可桢，正式走马上任。下午4点，他结束与教师的座谈，第一次面对浙大全校800多名学生和教职员工，发表了《大学教育之主要方针》演讲，表达出自己的教育思想。